Séminaires du LaRIA

Le séminaire du  LaRIA  a lieu le jeudi à partir de 14h00 en amphithéâtre Cassini, bâtiment des Minimes (sauf modification exceptionnelle).

Pour tous renseignements et/ou propositions d'exposés s'adresser Sidney Youlou

N.B. Ce semestre, les séminaires recherches se dérouleront en alternance avec les séminaires du Master Pro. Ils auront donc lieu tous les quinze jours uniquement.

Prochains séminaires (année 2006-2007) :

Dates Orateurs
Titres
25 septembre Xavier Défago (Japan Advanced Institute of Science and Technology )
Gathering oblivious mobile robots in finite time.
19 octobre
Pierre Lemarinier (LRI, Laboratoire de Recherche en Informatique, Orsay ) Protocoles à points de reprise coordonnés pour les systèmes de calcul à passage de  message.
9 novembre
Richard Groult (LaRIA, Laboratoire de Recherche en Informatique d'Amiens) Détection de répétitions en tandem avec évolution : application aux séquences biologiques.
21 décembre Eddy Caron (LIP, Laboratoire de l'Informatique du Parallélisme, Lyon) Service discovery in P2P network for grid computing
18 janvier
à 10h30
Julien Bernat (IML, Institut de Mathematiques de Luminy, Marseille) Algorithme des paires équilibrées irréductibles pour les langages substitutifs.
25 janvier Laurent Mouchard (Université de Rouen) Travaux récents et problèmes ouverts en combinatoire des mots pour la bioinformatique
15 février
Elöd Egyed-Zsigmond (LIRIS, Laboratoire d'InfoRmatique en Images et Systèmes d'information, INSA Lyon) Titre non disponible


Résumé des séminaires :

Gathering oblivious mobile robots in finite time.



Date
25 septembre 2006

Orateur
Xavier Défago (Japan Advanced Institute of Science and Technology)

Résumé

Just like any distributed system, reaching agreement among a set of mobile robots is a fundamental issue in distributed robotic systems. However, unlike traditional distributed systems, the physical location of the nodes is of primary importance. Reaching agreement in this context is often illustrated by the gathering problem. Namely, starting from any initial configuration, a group of robots sharing no knowledge of a global coordinate system must move to meet at a non-predetermined location. While being very simple to express, the gathering problem retains the inherent difficulty of agreement, namely the question of breaking symmetry between robots. In this presentation, I will give a general overview of the difficulties surrounding gathering, as well as a report on some of our most recent results. More specifically, I will first discuss the use of a compass to solve the gathering problem deterministically in a system with limited visibility and little synchrony. In particular, we have focused on the case where the compasses of the robots are either unstable or make bounded errors. After that, I will briefly report on the solvability of the gathering problem in the presence of faults, using synchrony or randomization.



Protocoles à points de reprise coordonnés pour les systèmes de calcul à passage de  messages.



Date
19 octobre 2006

Orateur
Pierre Lemarinier (Laboratoire de Recherche en Informatique, Orsay)

Résumé
L'accroissement du nombre de processeurs dans les systèmes de calcul  entraîne l'augmentation de la probabilité d'apparition d'une panne  franche lors de l'exécution d'une application numérique. Les recherches sur les environnements de calcul par passage de messages ont conduit à l'implémentation de plusieurs protocoles de tolérance aux pannes au sein de librairies MPI. Plusieurs approches ont été ainsi proposées, utilisant des protocoles de prises d'état coordonnés ou d'enregistrement de messages. Les protocoles à points de reprise coordonnés sont les plus fréquemment implémentés pour apporter la tolérance aux pannes dans les systèmes à passage de messages. Il en existe principalement deux classes : bloquant ou non bloquant. Nous avons implémenté ces deux protocoles au sein de la librairie MPICH, nous les avons évalué et comparé en terme de performance et de scalabilité et j'en présenterai les principaux résultats.


Détection de répétitions en tandem avec évolution : application aux séquences biologiques.



Date
9 novembre 2006

Orateur
Richard Groult (LaRIA, Laboratoire de Recherche en Informatique d'Amiens)







Résumé
Une "répétition en tandem avec évolution" consiste en une suite de copies plus ou moins contiguës où chaque copie est fortement similaire à celle qui la précède et à celle qui lui succède. Il n'existe pas de notion de modèle comme pour les répétitions en tandem "classiques" et la première et la dernière copie peuvent être complètement différentes. Ce "nouveau" type de répétition a été mis en évidence durant l'assemblage du génome humain.
Je commencerai par définir, de façon formelle, les répétitions en tandem avec évolution à partir des observations effectuées dans les séquences biologiques. Après avoir effectué des tests sur des logiciels de recherche de répétitions, je conclus qu'il n'existe pas de logiciel capable de les détecter efficacement. J'ai alors conçu des algorithmes capables de détecter ce type de répétitions. Ces algorithmes ont été implantés afin de mettre à disposition des biologistes des outils qui détectent efficacement ces répétitions dans de très grandes séquences génomiques, telles les chromosomes humains. Une méthode d'exécution sur une grille de calcul est également présentée. Les résultats des tests réalisés sur des chromosomes montrent la présence de ces répétitions dans plusieurs génomes.


 Service discovery in P2P network for grid computing.



Date
21 décembre 2006

Orateur
Eddy Caron (LIP, Laboratoire de l'Informatique du Parallélisme Lyon)






Résumé
Facing the limits of traditional tools of resource management within computational grids (related to scale, dynamicity, etc. of the platforms newly considered), new approaches, based on peer-to-peer technologies are emerging. The resource discovery and in particular the service discovery is concerned by this evolution. Among the solutions, a promising one is the indexing of resources using trie structures and more particularly prefix trees. The major advantages of trie-structured approaches is the capability to support search queries on ranges of values with a latency growing logarithmically in the number of nodes in the trie. Those techniques are easy to extend to multicriteria searches. One drawback of using tries is its inherent poor robustness in a dynamic environment, where nodes join and leave the network, leading to the split of the tree into a forest, which results in the impossibility to route requests. Within most recent approaches, the fault-tolerance is a prevention mechanism, often replication-based. Finally, we will give idea to deal with load balancing related to its mapping on the physical network.


Algorithme des paires équilibrées irréductibles pour les langages substitutifs. 



Date
18 janvier 2007

Orateur
Julien Bernat (IML, Institut de Mathematiques de Luminy, Marseille)







Résumé
Sous des hypothèses algébriques, certains systèmes dynamiques symboliques associés à des substitutions peuvent admettre une représentation géométrique. Dans ce cas, on peut établir des liens entre des propriétés de nature combinatoire, géométrique ou ergodique, et formuler de nombreuses questions encore non résolues.
Dans cet exposé, nous nous intéressons à l'étude de propriétés combinatoires. Après avoir rappelé les notions utiles à l'étude de systèmes substitutifs, nous montrerons comment l'étude des paires équilibrées irréductibles permet d'obtenir des informations sur l'algorithme des paires équilibrées. Nous nous intéresserons plus particulièrement aux cas des langages sturmiens, d'Arnoux-Rauzy, puis nous nous intéresserons à une  représentation géométrique discrète permettant d'étudier une classe de langages  substitutifs.


Travaux récents et problèmes ouverts en combinatoire des mots pour la bioinformatique. 



Date
25 janvier 2007

Orateur
Laurent Mouchard (Université de Rouen)







Résumé
Nous présenterons des résultats récents sur les structures d'indexation pour la recherche de généricite (facteurs de longueur maximale communs a un ensemble de séquences) ou de spécificité (facteurs minimaux propres a une séquences) ainsi que des résultats plus anciens sur un certain nombre de répétitions dans les séquences. Cet expose sera également l'occasion de présenter quelques problèmes ouverts d'intérêt, notamment les structures de donnes compressées, alternatives économiques aux structures a suffixes habituelles.


Titre non disponible. 



Date
15 février 2007

Orateur
Elöd Egyed-Zsigmond (LIRIS, INSA Lyon)







Résumé
A venir



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Mise à jour par Sidney Youlou
Dernières modifications : 22 janvier 2007